Le logiciel Kubios HRV permet d’analyser la variabilité de la fréquence cardiaque (VFC – ou HRV en anglais). La mesure est réalisée par une montre GPS capable de mesurer l’intervalle R-​R et équipée d’un capteur de fréquence cardiaque. L’acquisition des données sur l’ordinateur est prise en charge par le logiciel HRV tracker.

Je détaille ici mon flux de travaux avec la montre Garmin 910 XT et un Mac sous OS X Yosemite. Le procédé nécessite deux astuces.

Activation du mode HRV sur la montre Garmin 910 XT

Par défaut, le mode HRV est désactivé sur la Garmin 910 XT. Pour l’activer :

1. appuyer longuement sur START de façon à allumer la montre,
   
2. appuyer sur la touché MODE jusqu’à la page du menu,
   
3. appuyer sur les touches HAUT puis BAS, et répéter cette opération cinq fois au total.
   

S’affiche alors le menu caché des diagnostics :

1. appuyer deux fois sur BAS pour mettre Hrv-​OFF en surbrillance (en haut à droite),
   
2. appuyer deux fois sur ENTER pour sélectionner HRV,
   
3. appuyer sur BAS puis ENTER pour répondre “Oui” à la question “Do you want to enable HRV ?” et ainsi faire apparaître Hrv-​ON,
   
4. appuyer une fois sur MODE pour sortir du menu.
   

Installation de HRV tracker

Sans problème dans sa version 1.1, bien que le logiciel né semble plus maintenu (lien).

Installation de Kubios HRV

Le logiciel Kubios HRV est désormais disponible pour Mac dans sa version 2.2 :

1. installer Java pour OS X et non la version d’Oracle (explication),
   
2. et télécharger Kubios HRV pour Mac,
   
3. en suivant la procédure d’installation de Kubios HRV, procéder d’abord à l’installation du MATLAB Component Runtime (MCR),
   
4. puis procéder à l’installation de Kubios HRV.
   

Dans l’étape 3, il est demandé de modifier deux variables d’environnement. J’ai donc créé un fichier ~/.bash_profile contenant les lignes suivantes :

# On the target computer, append the following to your DYLD_LIBRARY_PATH environment variable:
export DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH:/Applications/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717/runtime/maci64:/Applications/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717/sys/os/maci64:/Applications/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717/bin/maci64:/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/JavaVM:/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Libraries
# Next, set the XAPPLRESDIR environment variable to the following value:
export XAPPLRESDIR=/Applications/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717/X11/app-defaults

source ~/.bash_profile

File > Edit Preferences > — Analysis options >

• Default Input Data Type = Polar HRM-​Files
  
• RR Interval Detrending = Smoothn priors